Die Musikschule Entfelden ist organisatorisch in die Schule Entfelden eingegliedert.

Die Schulpflege der Schule Entfelden ist Wahl- und Anstellungsbehörde für die Musikschulleitung und die MusiklehrerInnen.

Die fachliche und die administrative Musikschulleitung unterstehen der Schulleitung der Schule Entfelden.